Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms