Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LUMP51884 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LUMP51884 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LUMP51884 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LUMP51884 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LUMP51884 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LUMP51884 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LUMP51884 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LUMP51884 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LUMP51884 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms