Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDGFP51858 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDGFP51858 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDGFP51858 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDGFP51858 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDGFP51858 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDGFP51858 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDGFP51858 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDGFP51858 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms