Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms