Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA4P51532 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA4P51532 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA4P51532 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA4P51532 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA4P51532 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA4P51532 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SMARCA4P51532 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SMARCA4P51532 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
SMARCA4P51532 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
SMARCA4P51532 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
SMARCA4P51532 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms