Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAMP50895 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAMP50895 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms