Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP153P49790 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP153P49790 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP153P49790 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP153P49790 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP153P49790 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms