Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFBP49765 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms