Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPFP49454 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPFP49454 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPFP49454 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPFP49454 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPFP49454 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPFP49454 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPFP49454 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms