Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NESP48681 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NESP48681 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NESP48681 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NESP48681 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NESP48681 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NESP48681 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NESP48681 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NESP48681 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NESP48681 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NESP48681 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NESP48681 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NESP48681 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms