Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD52P43351 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD52P43351 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD52P43351 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD52P43351 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD52P43351 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD52P43351 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD52P43351 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD52P43351 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD52P43351 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD52P43351 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms