Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms