Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms