Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms