Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms