Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms