Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF2P35240 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF2P35240 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF2P35240 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NF2P35240 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms