Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP1P32455 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP1P32455 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP1P32455 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBP1P32455 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms