Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTX2P32243 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms