Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC12P31275 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms