Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms