Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCND2P30279 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCND2P30279 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCND2P30279 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCND2P30279 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms