Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms