Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms