Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD1BP29016 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD1BP29016 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD1BP29016 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD1BP29016 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD1BP29016 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD1BP29016 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms