Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms