Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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