Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms