Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HRCP23327 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HRCP23327 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HRCP23327 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HRCP23327 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HRCP23327 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HRCP23327 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HRCP23327 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HRCP23327 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HRCP23327 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HRCP23327 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HRCP23327 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HRCP23327 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms