Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms