Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LIG1P18858 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIG1P18858 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIG1P18858 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIG1P18858 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms