Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME1P15531 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME1P15531 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME1P15531 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME1P15531 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms