Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms