Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms