Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms