Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB1P08034 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB1P08034 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJB1P08034 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB1P08034 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB1P08034 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms