Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms