Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms