Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA1P02647 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA1P02647 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOA1P02647 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOA1P02647 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOA1P02647 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOA1P02647 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOA1P02647 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms