Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD1O95696 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRD1O95696 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD1O95696 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD1O95696 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD1O95696 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms