Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms