Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms