Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTIFO43310 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTIFO43310 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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