Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD3O43242 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD3O43242 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms