Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MSH5O43196 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSH5O43196 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSH5O43196 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms