Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L1O43166 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms