Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA5O15230 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA5O15230 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms