Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms