Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRTO14522 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRTO14522 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRTO14522 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRTO14522 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRTO14522 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRTO14522 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRTO14522 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRTO14522 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRTO14522 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRTO14522 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRTO14522 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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