Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms